Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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