Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms