Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms