Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms