Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms