Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Abcf3Q8K268 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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Abcf3Q8K268 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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