Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms