Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms