Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms