Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Nbdy-204ENSMUST00000185492 1346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm14326-203ENSMUST00000108932 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Tac1-201ENSMUST00000090679 980 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trim35Q8C006 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gpx5-201ENSMUST00000110491 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Olfr1128-201ENSMUST00000102624 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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