Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ctdsp2Q8BX07 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Ctdsp2Q8BX07 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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Ctdsp2Q8BX07 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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