Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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