Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usp54Q8BL06 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usp54Q8BL06 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp54Q8BL06 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp54Q8BL06 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp54Q8BL06 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp54Q8BL06 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp54Q8BL06 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp54Q8BL06 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp54Q8BL06 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Usp54Q8BL06 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Usp54Q8BL06 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Usp54Q8BL06 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Usp54Q8BL06 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Usp54Q8BL06 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp54Q8BL06 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms