Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnrc6bQ8BKI2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms