Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms