Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim19Q80ZU4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
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Smim19Q80ZU4 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Smim19Q80ZU4 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
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Smim19Q80ZU4 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Smim19Q80ZU4 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Smim19Q80ZU4 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Smim19Q80ZU4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
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Smim19Q80ZU4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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