Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Amigo1Q80ZD8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Amigo1Q80ZD8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Amigo1Q80ZD8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Amigo1Q80ZD8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Amigo1Q80ZD8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Amigo1Q80ZD8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Amigo1Q80ZD8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Amigo1Q80ZD8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms