Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SnupnQ80W37 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SnupnQ80W37 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms