Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ell3Q80VR2 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ell3Q80VR2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ell3Q80VR2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ell3Q80VR2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ell3Q80VR2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ell3Q80VR2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ell3Q80VR2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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