Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms