Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms