Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms