Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ33

Rgmb, RGM domain family member B, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmbQ7TQ33 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RgmbQ7TQ33 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmbQ7TQ33 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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