Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Shq1Q7TMX5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms