Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms