Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms