Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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