Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltcQ68FD5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms