Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Taf6Q62311 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Taf6Q62311 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Taf6Q62311 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Taf6Q62311 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Taf6Q62311 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Taf6Q62311 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Taf6Q62311 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Taf6Q62311 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Taf6Q62311 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Taf6Q62311 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Taf6Q62311 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Taf6Q62311 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Taf6Q62311 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Taf6Q62311 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Taf6Q62311 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Taf6Q62311 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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