Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Sall3Q62255 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Sall3Q62255 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Sall3Q62255 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Sall3Q62255 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Sall3Q62255 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Sall3Q62255 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Sall3Q62255 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Sall3Q62255 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Sall3Q62255 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Sall3Q62255 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Sall3Q62255 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms