Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms