Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms