Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms