Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbbp7Q60973 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms