Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms