Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms