Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trim58Q5NCC9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trim58Q5NCC9 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trim58Q5NCC9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trim58Q5NCC9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trim58Q5NCC9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trim58Q5NCC9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trim58Q5NCC9 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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