Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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Fam220aQ3ZN08 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Fam220aQ3ZN08 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Fam220aQ3ZN08 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Fam220aQ3ZN08 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Fam220aQ3ZN08 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Fam220aQ3ZN08 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Fam220aQ3ZN08 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Fam220aQ3ZN08 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Fam220aQ3ZN08 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Fam220aQ3ZN08 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Fam220aQ3ZN08 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Fam220aQ3ZN08 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Fam220aQ3ZN08 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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