Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Dnah12Q3V0Q1 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Dnah12Q3V0Q1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Dnah12Q3V0Q1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Dnah12Q3V0Q1 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Dnah12Q3V0Q1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Dnah12Q3V0Q1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Dnah12Q3V0Q1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Dnah12Q3V0Q1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Dnah12Q3V0Q1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Dnah12Q3V0Q1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms