Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms