Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms