Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UPC7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms