Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms