Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Rnf149Q3U2C5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Rnf149Q3U2C5 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Rnf149Q3U2C5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Rnf149Q3U2C5 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Rnf149Q3U2C5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Rnf149Q3U2C5 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Rnf149Q3U2C5 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Rnf149Q3U2C5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Rnf149Q3U2C5 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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