Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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