Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12576-201ENSMUST00000135268 3036 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms