Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp1aQ2LKU9 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms