Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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