Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Spatc1Q148B6 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Spatc1Q148B6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Spatc1Q148B6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Spatc1Q148B6 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Spatc1Q148B6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
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Spatc1Q148B6 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms