Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms